W sezonie 1999/2000 strzelił 10 goli dla Sparty i był drugim najlepszym strzelcem zespołu po Vratislavie Lokvencu (22 bramki) przyczyniając się do swojego trzeciego z rzędu mistrzostwa kraju, a dodatkowo dotarł ze Spartą do drugiej fazy grupowej LM.
Latem 2000 roku Baranek trafił do niemieckiego 1. FC Köln. W Bundeslidze zadebiutował 13 sierpnia w przegranym 1:2 meczu z FC Schalke 04. W zespole z Kolonii był jednak na ogół rezerwowym i strzelił 2 gole w sezonie, a FCK zajęło 10. miejsce w Bundeslidze. W sezonie 2001/2002 także spisał się poniżej oczekiwań i z Köln spadł z ligi.
W 2002 roku Baranek wrócił do Czech i ponownie został zawodnikiem Sparty, ale grał w niej tylko sporadycznie. W 2003 i 2005 miał niewielki udział w wywalczeniu mistrzostwa kraju, a w 2004 Pucharu Czech. Zimą 2005 Baranek przeszedł do FK Mladá Boleslav, gdzie spędził pół roku i pomógł zespołowi w utrzymaniu w lidze. W roku 2005 Baranek zostałem piłkarzem FK Jablonec 97. Po trzech latach gry w tej drużynie przeszedł do austriackiego Admira Wacker Mödling.