65% terenów odpowiednich dla gatunku nie pozostaje pod ochroną.

Do zagrożeń należy zwłaszcza niszczenie siedlisk, i tak już rozczłonkowanych, przekształcanych z bagnistych łąk na tereny rolnicze. Ponadto na barasingę bagienną się poluje, aczkolwiek jej mięso nie uchodzi za smaczne, ustępując aksisowi bengalskiemu czy czytalowi. Poluje się na nią też dla poroża i skóry, używanej choćby do produkcji biczów. To właśnie polowania spowodowały wymarcie barasingi bagiennej w Sundarbanach. Zabijają je także pożary, powodzie i malaria, szkodzą wprowadzone rośliny Cymbopogon czy Sesbania. Niestety podgatunki ograniczone do jednego i dwóch stad zniszczyć może choroba czy niekorzystna pogoda. Konkurują z nią gatunki wprowadzone przez człowieka.