EVANGELION:1.0 You Are (Not) Alone Pierwszy film tetralogii odpowiada pierwszym sześciu odcinkom oryginalnej serii telewizyjnej. Fabuła filmu nie różni się znacząco od fabuły serii telewizyjnej; wiele scen w filmie jest niemal identycznych z odpowiadającymi im scenami z serii, z tym, że przy ich tworzeniu wykorzystano tym razem grafikę 3D CG technology, co nie było możliwe w 1995 roku.
Jedną z różnic jest logo NERV-u i SEELE. Dwie wersje nowego logo zawierają w sobie słowo NERV ze starym mottem God’s in his heaven, all’s right with the world, czyli Bóg w swych niebiosach, ze światem wszystko w porządku. Zachowano również liść figowy z oryginalnego logo. Drugi projekt to oryginalne logo, z tym, że litera V w słowie NERV została zmieniona. Nowe logo SEELE powiela stary projekt (trójkąt z siedmioma oczami), ale całość oplata wąż, znajduje się na nim również napis Überm Sternenzelt richtet Gott, wie wir gerichtet, który pochodzi z 71. i 72. wiersza Ody do radości Friedricha Schillera.