Pierwszym rektorem zostaje Stanisław Rozdrażewski; 1563-1571 – funkcję dyrektora pełni Jakub Wujek; 1566 – utworzenie przy szkole pierwszego w Polsce teatru publicznego; 1568 – szkołę odwiedza Jan Kochanowski; 1571-1573 – w szkole wykłada Piotr Skarga; 1590 – wizyta króla Zygmunta III Wazy. 1773 – po likwidacji zakonu jezuitów, na mocy zarządzenia Komisji Edukacji Narodowej, kolegium uzyskuje status wojewódzkiej szkoły podwydziałowej kształcącej na poziomie średnim; 1781 – opiekę nad szkołą przejmują sprowadzeni z Płocka benedyktyni; 1797-1798 – dwukrotny pożar szkoły, budowa nowej siedziby; 1806-1807 oraz 1812-1813 – zajęcie budynku szkoły przez wojska napoleońskie; 1831 – 6-klasowa szkoła wojewódzka odebrana benedyktynom, staje się 4-klasową szkołą obwodową; 1872 – wprowadzenie języka rosyjskiego jako wykładowego; 1902 – utworzenie 7-klasowego gimnazjum; 3 lutego 1905 – strajk uczniów przeciwko wzmożonej rusyfikacji; 1913 – powstanie organizacji harcerskiej i tajnych organizacji niepodległościowych; 1915 – po wyzwoleniu spod jarzma rosyjskiego, szkoła przyjmuje za patrona Piotra Skargę; 1918 – szkoła przyjmuje nazwę Męskie Gimnazjum i Liceum Państwowe im.