18 kwietnia 1854 roku jej matka, arcyksiężniczka Elżbieta, wyszła za mąż za arcyksięcia Karola Ferdynanda, księcia Czech, z którym miała szóstkę dzieci: arcyksiążę Franciszek Józef (1855); arcyksiążę Fryderyk (1856–1936); arcyksiężniczka Maria Krystyna (1858–1929), późniejsza żona króla Hiszpanii Alfonsa XII; arcyksiążę Karol Stefan (1860–1933); arcyksiążę Eugeniusz (1863–1954); arcyksiężniczka Maria Eleonora (1864).
Poprzez matkę była kuzynką arcyksiężniczki Stefanii Klotyldy, żony następcy tronu Austrii arcyksięcia Rudolfa, Klementyny Koburg-Bonaparte, żony pretendenta do cesarskiego tronu Francji, i Marii Doroty, księżnej Orleanu.
Jakobicka pretendentka Była bratanicą i spadkobierczynią bezdzietnego Franciszka V, księcia Modeny, jakobickiego pretendenta do tronu Anglii i Szkocji. Po śmierci księcia Franciszka w 1875 roku była nazywana przez jakobitów królową Marią IV i III. Jej najstarszy syn Rupert był uznawany przez jakobitów jako jej następca.