Jakobicka pretendentka Jej praprababką była Maria Teresa Habsburg-Este, która jako bratanica zmarłego bezdzietnie Franciszka V odziedziczyła po nim tytuł jakobickiego pretendenta do tronu Anglii i Szkocji. Po jej śmierci trafił on do jej syna Ruperta, a następnie do Alberta – dziadka Zofii. Kiedy Albert Bawarski zmarł, tytuły otrzymał jego najstarszy syn, Franciszek I Wittelsbach, czyli stryj Zofii. Nie ma on potomków, dlatego dziedzicem jego tytułów będzie jego brat – Max Emanuel, a więc ojciec księżniczki. Zofia Bawarska jest zatem druga w linii sukcesji tytułu jakobickiej pretendentki do tronu Anglii i Szkocji, a kolejny jest jej najstarszy syn, Józef Wacław.
Małżeństwo i potomstwo 3 lipca 1993 roku wyszła za mąż za Alojzego Liechtensteina, z którym ma czworo dzieci:
Józef Wacław (niem. Joseph Wenzel Maximilian Maria; ur. 24 maja 1995 w Londynie). Maria Karolina (niem. Marie-Caroline Elisabeth Immaculata; ur. 17 października 1996 w Grabs). Jerzy (niem. Georg Antonius Constantin Maria; ur. 20 kwietnia 1999 w Grabs). Mikołaj (niem. Nikolaus Sebastian Alexander Maria;