W odwecie świątynie zostały przez najeźdźców splądrowane i spalone, a ludność wywieziona i osiedlona w okolicach Suzy, gdzie jednak zachowała swój język i zwyczajeNicholas Hammond: Dzieje Grecji. Warszawa: PIW, 1994, s. 267; 271, .. Z Eretrii (Eubei) Persowie wyruszyli następnie przeciwko Atenom, lecz zostali pokonani w batalii pod Maratonem.
Dzięki odbudowie i późniejszemu rozwojowi większość okazałych budowli, których pozostałości zachowały się do dzisiaj, pochodzi V–IV wieku p.n.e. Po klęsce Greków pod Cheroneą w 338 p.n.e. eubejskie polis zostało zajęte przez macedońskiego Filipa II, a w połowie II wieku p.n.e. wraz z resztą ziem greckich znalazło się pod władzą RzymianDavid Sacks: Encyklopedia świata starożytnych Greków. Warszawa: Książka i Wiedza, 2001, s. 136, ..
W 198 p.n.e. Eretria decyzją rzymskiego senatu miała być przekazana Eumenesowi II z Pergamonu, lecz sprzeciwił się temu konsul Tytus Kwinkcjusz Flamininus, proklamujący Grekom wolność podczas igrzysk istmijskichMichael Crawford: Rzym w okresie republiki. Warszawa: Prószyński i S-ka, 1992, s. 75, .. Miasto ostatecznie zostało zburzone podczas pierwszej wojny Sulli z Mitrydatesem w 87 p.n.e.