Kontrowersje W nocy 17 sierpnia 1978 roku będąc na pokładzie jachtu Cocke, aby odzyskać swoją łódkę, ze skutkiem śmiertelnym postrzelił śpiącego na pokładzie jachtu Mapagia 19-letniego Dirka Hamera. Po trwającym 13 lat procesie uznany został za winnego nielegalnego posiadania broni palnej i skazany na karę sześciu miesięcy pozbawienia wolności z warunkowym zawieszeniem wykonania kary. Prokurator wycofał zarzut zabójstwa. 16 czerwca 2006 roku został aresztowany i oskarżony o korupcję i stręczycielstwoPeter Popham, Son of Italy’s last king held over Mafia and prostitution claims The Independent 17 June 2006, [dostęp 24.08.2010].. W 2007 roku Vittorio Emanuele i jego syn Emanuel Filibert zgłosili wniosek o odszkodowanie od państwa włoskiego w wysokości 260 000 000 euro tytułem strat finansowych i krzywd moralnych oraz zwrotu nieruchomości. Rząd włoski odrzucił te żądaniaFallen Savoy royals seek damages over Italy exile Reuters 21.11.2007 [dostęp 24.08.2010].. W czerwcu 2006 roku jego kuzyn – Amadeo, książę Aosty ogłosił siebie głową rodziny sabaudzkiej i prawowitym księciem Sabaudii, tym samym zakwestionował prawa Vittorio Emanuele i jego syna.