Rada ds. Ogólnych () Rada ds. Zagranicznych () Rada ds. Gospodarczych i Finansowych () Rada ds. Wymiaru Sprawiedliwości i Spraw Wewnętrznych () Rada ds. Zatrudnienia, Polityki Społecznej, Zdrowia i Ochrony Konsumentów () Rada ds. Konkurencyjności () Rada ds. Transportu, Telekomunikacji i Energii () Rada ds. Rolnictwa i Rybołówstwa () Rada ds. Środowiska () Rada ds. Edukacji, Młodzieży, Kultury i Sportu (S).
Przewodniczącym Rady jest minister z kraju sprawującego aktualnie prezydencję, z wyjątkiem Rady ds. Zagranicznych, której przewodniczy zawsze wysoki przedstawiciel do spraw zagranicznych i polityki bezpieczeństwa. Prezydencja Rady przypada co pół roku na kolejne państwo członkowskie.
Obsługę Rady zapewnia Sekretariat, na czele którego stoi sekretarz generalny (obecnie Thérèse Blanchet, kadencja 2022–2027Sekretariat Generalny Rady). Sekretarz generalny od 18 września 1999 r. do 30 listopada 2009 r. z urzędu pełnił też funkcję wysokiego przedstawiciela do spraw wspólnej polityki zagranicznej i bezpieczeństwa. Funkcję tę sprawował na mocy decyzji traktatu amsterdamskiego, natomiast utracił na mocy postanowień traktatu lizbońskiego.