W tym samym czasie Christopher zbierał także haracze od dilerów narkotyków dopóki ekipa Juniora nie przejęła jego terenu.
Junior był wściekły na Christophera, ponieważ obwiniał go o utratę autorytetu i zaplanował jego egzekucję. Matka Tony’ego, Livia, wstawiła się za nim, ponieważ kiedyś wstawił jej okna w domu i prawdopodobnie to wpłynęło na jego los. Został porwany spod budki z Hot-dogami i wywieziony na pobliskie mokradła przez dwóch Rosjan działających na zlecenie Juniora. Moltisanti był tak przerażony, że stracił kontrolę nad swoim organizmem. Mniej szczęścia miał Brendan Filone, który został zabity strzałem w oko. Egzekucji dokonał Mickey Palmice, który pod koniec sezonu został zabity przez Moltisantiego na zlecenie Soprano.
Christopher brał także udział w morderstwie Jimmy’ego Altieri. Moltisanti zwabił go do pokoju hotelowego, gdzie został zabity strzałem w głowę przez Silvia Dante.