lewo|280px Podział administracyjny Gagauzji
Administracyjnie obszar Gagauzji dzieli się na: rejony (dolay), miasta oraz wsie (komuny). Stolicą Gagauzji jest Komrat (gag. Comrat), miasto liczące niegdyś ok. 36 tys. mieszkańców, a obecnie niewiele ponad 20 tysięcy. Poza nią w granicach Gagauzji znajdują się tylko dwa miasta: Ceadîr-Lunga (gag. Cadır Lunga) oraz Vulcănești (gag. Valkaneş). Wszystkie trzy są zarazem miastami rejonowymi. Liczba wsi (komun) przynależących do Gagauz Yeri wynosi 23, jednakże punktów osadniczych jest więcej, gdyż w skład komuny (miejskiej lub wiejskiej) może wchodzić kilka miejscowości.
Obecnie Komratowi podlega 12 wsi (komun): Avdarma Beşalma Buçak (Budjak) Köselia Ruse (Köseli Rus) Kirsovo Çokmeydan (Çokmaydan) Kongaz Kongazçik (składa się zw wsi: Kongazçik Yukarkı, Kongazçik Assakı oraz chutoru Duduleşt) Kotovskoe (Kırlannar) Dezghingea (Dezgincä) Ferepontevka (Ferapontievka, Parapontika) Svetlıy (do komuny tej należy także chutor Alekseevka).
Miastu Czadyr Łunga (Çadır Lunga) podlega 8 wsi (komun) Baurçi (Baurci) Beşgöz Kazayak Kiriet Lunga Kıpçak (Kopçak) Gaydar (Haydar) Joltay Tomay