Dzięki umowom na promocje aukcji z portalami internetowymi liczba użytkowników wzrosła do kilkuset tysięcy w ciągu kilku pierwszych lat.
Po pęknięciu bańki internetowej spółka pogrążyła się w konflikcie właścicielskim między założycielami a QXL Ricardo, wywołanym odmienną wizją rozwoju serwisu. Po wejściu serwisu eBay do Polski strony zakończyły spór ugodą w 2006 roku, na mocy której QXL Ricardo na nowo przejęło kontrolę nad Allegro. Firma zaczęła przejmować takie serwisy jak OtoMoto czy porównywarkę cen Ceneo oraz zmieniać interfejs.
W 2008 roku południowoafrykański koncern mediowy Naspers, właściciel Gadu-Gadu w Polsce, kupił spółkę Tradus (dawniej QXL Ricardo) za około 1 mld funtów, czyli ok. 1,5 mld euro, stając się nowym właścicielem AllegroNaspers kupił Allegro.pl.. W czerwcu 2009 roku Naspers, poprzez należącą do niego spółkę MIH Allegro B.V., wezwał do sprzedaży 100% akcji notowanej na warszawskiej giełdzie firmy Bankier.pl S.A. – właściciela między innymi portali Bankier.pl i Mojeauto.pl. Po przejęciu wszystkich akcji Bankier.pl S.A. został wycofany z giełdy w 2010 rokuBankier.pl znika z GPW..