miejsce, pokonując tunezyjski CS Sfaxien 2:0 oraz remisując z Al-Hilal oraz syryjskim Al-Jaish Damaszek.
W latach 2002–2005 zespół nie zakwalifikował się do udziału w żadnych rozgrywkach międzynarodowych, a w lidze zajął 4. miejsce w sezonie 2002/2003 i 2004/2005 oraz 6. pozycję w sezonie 2003/2004. W tych trzech kolejnych sezonach, Al-Nassr za każdym razem doszedł do półfinału Pucharu Korony Księcia Arabii Saudyjskiej. W 2006 saudyjska drużyna, po trzyletniej przerwie w rozgrywkach międzynarodowych, dotarła do ćwierćfinału Arabskiej Ligi Mistrzów.
W sezonie 2006/2007 klub był bliski spadku z Professional League, w której gra od początku jej utworzenia. Zespół zajął w klasyfikacji końcowej 9. pozycję (na 12 zespołów) i był 3 punkty nad strefą spadkową. W Arabskiej Lidze Mistrzów drużyna zajęła 3. miejsce w fazie grupowej i zakończyła rozgrywki na tym etapie.
Al-Nassr, po raz drugi, w sezonie 2007/2008 wygrał Puchar Federacji Arabii Saudyjskiej, pokonując w finale Al-Hilal 2:1, a rok później doszedł do finału, w którym przegrał po rzutach karnych z Asz-Szabab Rijad. W tamtych sezonach Saudyjczycy ukończyli rozgrywki ligowe na piątej pozycji.