W 1947 roku jednostka ta uległa reorganizacji i podziałowi na dwa wydziały: Matematyki, Fizyki i Chemii, który nadal był wspólny dla obu wrocławskich uczelni oraz Wydział Nauk Przyrodniczych, wchodzący wyłącznie w struktury Uniwersytetu Wrocławskiego.
Dynamiczny rozwój jednostek naukowo-dydaktycznych wchodzących w skład wyżej wymienionego wydziału spowodował dokonanie jego podziału na trzy mniejsze wydziały: Wydział Biotechnologii, Nauk Biologicznych oraz Wydział Nauk o Ziemi i Kształtowania Środowiska, co miało miejsce 1 września 2006 roku.
Władze Wydziału W kadencji 2024–2028: Stanowisko Imię i nazwiskoDziekan dr hab. Prodziekan ds. studenckich dr Joanna ŁubockaProdziekan ds. nauczania dr hab. Elżbieta MyśkowProdziekan ds. nauki i rozwoju dr hab. Donata Wawrzycka
Poczet dziekanów prof. dr hab. Wiesław Fałtynowicz (2006–2011) prof. dr hab. Dariusz Skarżyński (2011–2020) prof. dr hab. inż. Marcin Kadej (2020–2024) dr hab.