U rasy opisywano też schorzenia o podłożu dziedzicznym lub wrodzonym. Zwichnięcie rzepki należy do częstszych problemów ortopedycznych ras miniaturowych, w tym maltańczyka, i objawia się przerywanym, „podskakującym" chodem jednej z tylnych kończyn. Wśród wad wrodzonych serca opisywano u tej rasy przetrwały przewód tętniczy (PDA); nieleczony prowadzi zwykle do niewydolności krążenia w ciągu pierwszego roku życia. U dorosłych osobników rasy opisano też zespół drżenia uogólnionego, potocznie nazywany zespołem drżenia białych piesków, o podłożu autoimmunologicznym, dobrze reagujący na leczenie kortykosteroidami. Rasa jest ponadto nadreprezentowana wśród psów z wrodzonym zespoleniem wrotno-systemowym wątroby, wadą naczyniową omijającą wątrobę.
Zachowanie i charakter Maltańczyk jest psem towarzyskim, łatwym do ułożenia i aktywnym – lubi zabawę, nadaje się do udziału w agility. Toleruje osoby mu nieznane. Jest bardzo posłuszny oraz szybko się uczy. Przeciętna długość życia u maltańczyków wynosi od 14 do 16 lat.