Józef Dobosz
Zakład Historii Starożytnego Wschodu Zakład Historii Społeczeństw Antycznych Zakład Historii Średniowiecznej Zakład Historii Nowożytnej do XVIII wieku Zakład Historii Powszechnej XIX i XX wieku Zakład Historii Polski XIX i XX wieku Zakład Najnowszej Historii Polski Zakład Bałkanistyki Zakład Historii Kultury Zakład Historii Gospodarczej Zakład Historii Wojskowej Zakład Źródłoznawstwa i Nauk Pomocniczych Historii Zakład Archiwistyki Zakład Dydaktyki Historii Zakład Metodologii Historii i Historii Historiografii Zakład Kultury i Myśli Politycznej Pracownia Bohemistyczna Pracownia Historii Bizancjum
Instytut Archeologii
Dyrektor: prof. dr hab. Hanna Kóčka-Krenz
Zakład Epok Kamienia i Brązu Zakład Prahistorii Powszechnej Epoki Żelaza Zakład Prahistorii Europy Środkowo-Wschodniej Zakład Teorii i Metod w Archeologii Zakład Archeologii Cywilizacji Śródziemnomorskich Pracownia Archeologii Śródziemnomorskiej Epoki Brązu
Instytut Historii Sztuki
Dyrektor: dr hab. Piotr Korduba
Zakład Sztuki Średniowiecznej Zakład Sztuki Nowożytnej Zakład Sztuki Nowoczesnej Zakład Historii i Teorii Badań nad Sztuką Pracownia Dokumentacji Życia Artystycznego
Instytut Wschodni
Dyrektor: prof. dr hab.