Struktura organizacyjna Do 5 marca 2020 ministerstwo obsługiwało również ministra właściwego dla działu administracji rządowej członkostwo Rzeczypospolitej Polskiej w Unii Europejskiej (od 5 marca 2020 ministra kierującego tym działem obsługuje Kancelaria Prezesa Rady Ministrów).
W skład ministerstwa wchodzi Gabinet Polityczny Ministra oraz następujące jednostki organizacyjne Departament Afryki, Bliskiego Wschodu i Ameryki Łacińskiej; Departament Ameryki Północnej; Departament Azji i Pacyfiku; Departament Dyplomacji Kulturalnej i Promocji Polski; Departament Ekonomiczny; Departament Koordynacji Spraw Unii Europejskiej Departament Komunikacji Strategicznej i Przeciwdziałania Dezinformacji Międzynarodowej; Departament Konsularny; Departament Polityki Bezpieczeństwa; Departament Polityki Europejskiej; Departament Polityki Rozszerzenia i Sąsiedztwa Wschodniego; Departament Polityki Zewnętrznej Unii Europejskiej; Departament Prawa Unii Europejskiej; Departament Prawno-Traktatowy; Departament Spraw Globalnych; Departament Strategii; Departament Wschodni; Departament Współpracy Rozwojowej; Departament Współpracy z Polonią i Polakami za Granicą; Akademia Dyplomatyczna; Biuro Administracji; Biuro Bezpieczeństwa Dyplomatycznego; Biuro Finansów; Biuro Informatyki i Telekomunikacji; Biuro Infrastruktury; Biuro