Studenci politologii od IV semestru realizowali program specjalizacji, wybierany przez nich spośród trzech dostępnych: marketing polityczny, administracja europejska, administracja samorządowa.

Ponadto Instytut oferował studia podyplomowe (Podyplomowe Studia Nauk Politycznych, Studia Podyplomowe w zakresie Wiedza o Społeczeństwie finansowane z Europejskiego Funduszu Społecznego, Podyplomowe Studia Zarządzania w Stanach Szczególnych Zagrożeń Państwa i Podyplomowe Studia Bezpieczeństwa Wewnętrznego), studia w języku angielskim (Master's Degree in European Studies, Master's Degree in Political Studies, Postdiploma Polish Studies) oraz studia doktoranckie (trzyletnie, w trybie niestacjonarnym zaocznym).

Organizacja Instytutu Ostatnią dyrektorką Instytutu była dr hab. Ewa Marciniak. Zastępcą dyrektora ds. dydaktycznych był dr hab. Tomasz Słomka, zaś zastępcą ds. naukowych i współpracy z zagranicą był dr Marcin Tobiasz.

Siedzibą Instytutu był pałac Zamoyskich. Sekretariat i dziekanat znajdowały się na drugim piętrze budynku przy Krakowskim Przedmieściu 3. Zajęcia odbywały się również w innych budynkach Uniwersytetu – m.in.