Podstawy kontroli resortowej na szczeblu ministerialnym określa Rada Ministrów, na mocy której minister posiada szeroki wachlarz uprawnień, m.in.:
kontrola działalności organów podporządkowanych, urzędów, jednostek organizacyjnych według art. 34 ust. 1 (kreuje jednostki organizacyjne, obsadza kierowników na stanowiskach kierowniczych- wiąże się to z organizacją kontroli działania, efektywności gospodarowania, przestrzeganie prawa przez jednostki organizacyjne), nadzór i kontrola działalności organów i jednostek organizacyjnych, nad którymi sprawuje nadzór zgodnie z art. 34. ust. 2, do nadzoru nad pozostałymi organami centralnymi (urzędami centralnymi) – zakres tych kompetencji reguluje przepisy ustanawiające linię podporządkowania organu centralnego,
Kontrola sprawowana przez organy danej jednostki organizacyjnej wobec niej samej, czyli kontrola wewnętrzna w urzędach organów administracji publicznej. Jej podstawy prawne są zróżnicowane, a głównym jej zadaniem jest kontrolowanie wewnętrznej działalności danej jednostki. Głównym organem administracji publicznej są urzędy, a więc kontrolowani są kierownicy poszczególnych komórek urzędu, jak również wszyscy pracownicy.