Flora Europaea – pięciotomowa encyklopedia europejskich roślin naczyniowych opublikowana w latach 1964-1993 przez wydawnictwo Cambridge University Press. Głównym celem publikacji było zebranie danych rozproszonych we florach krajowych w jednym dziele z umożliwieniem identyfikacji (oznaczenia) roślin dziko występujących i uprawianych w Europie do poziomu podgatunku. Według zestawienia w piątym tomie dzieła całość Flora Europaea zawiera opis 11557 gatunków w obrębie 1541 rodzajów. Flora zawiera także informacje o rozmieszczeniu geograficznym, preferencjach siedliskowych i liczbie chromosomów.
Flora Europaea została opublikowana w 2001 r. w formie CD, a za sprawą Królewskiego Ogrodu Botanicznego w Edynburgu (ang. Royal Botanic Garden Edinburgh) została także opublikowana w Internecie.
Historia Idea opracowania ogólnoeuropejskiej Flory miała swój początek na 8. Międzynarodowym Kongresie Botanicznym w Paryżu w 1954 roku. Pierwszy tom opublikowany został w roku 1964, w kolejnych latach ukazywały się kolejne tomy i w końcu ostatni (piąty) ukazał się w 1980 roku. Z honorariów autorskich utworzony został fundusz zarządzany przez Towarzystwo Linneuszowskie (ang. Linnean Society) z Londynu, który pozwolił na kontynuację prac nad Florą przez dr Johna Akeroyda.