Józefa Mackiewicza (2003) Grant „The Earhart Foundation Fellowship” (2004) Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski (2007) „za wybitne zasługi dla niepodległości Rzeczypospolitej Polskiej, za działalność na rzecz przemian demokratycznych, za osiągnięcia w podejmowanej z pożytkiem dla kraju pracy zawodowej i działalności społecznej”. Grant „Smith Richardson Fellowship” (2009–2010) Weteran honoris causa polskiej Korporacji Akademickiej Respublica
Publikacje W języku polskim Ciemnogród? O Prawicy i Lewicy. Warszawa: Oficyna Wydawnicza Fulmen-Poland, 1996, . Zagrabiona pamięć: Wojna w Hiszpanii, 1936-39. Warszawa: Fronda, 1997. . Tajne Oblicze: Dokumenty GL-AL i PPR, 1942-1945. Tomy 1-3, Warszawa: Burchard Edition, 1997-1999. (współredaktorzy: Leszek Żebrowski, Piotr Gontarczyk) Narodowe Siły Zbrojne: „Ząb” przeciw dwu wrogom. 3 wyd.: 1994, 1999, 2004 Żydzi i Polacy 1918-1955: Współistnienie, Zagłada, Komunizm. Warszawa, wyd. Fronda, 2000 (wyd. 2 2011). . Ejszyszki. Kulisy zajść w Ejszyszkach: Epilog stosunków polsko-żydowskich na Kresach, 1944-45: Wspomnienia-dokumenty-publicystyka. Tomy 1-2. Warszawa, wyd. Fronda, 2002 (2 wyd. 2010). . Ronald Reagan: „Moja wizja Ameryki”. Warszawa: Arwil, 2004. (współredaktorzy: Paweł Toboła-Pertkiewicz, Paweł Włodarski) Po Zagładzie. Stosunki polsko-żydowskie 1944–1947.