Geograficznie leży w północno-zachodniej części Niziny Wielkopolskiej, w kotlinowatym rozszerzeniu doliny Obry, pomiędzy pagórkami międzyrzecko-pniewskimi, równiną nowotomyską i pagórkami świebodzińsko-sulęcińskimiPraca zbiorowa pod redakcją T. Łuczaka i D. Matyaszczyk, Międzyrzecz i okolice – Środowisko geograficzne okolic Międzyrzecza, Międzyrzecz – Gorzów Wlkp., 1998, s. 8..
Według danych z 1 stycznia 2025 powierzchnia miasta wynosiła 13,94 km².
Częściami miasta Międzyrzecz są: Obrzyce (TERYT 0935535) i Winnica (TERYT 0935541).
Odległości z centrum Międzyrzecza do centrów innych większych miastLokalny Program Rewitalizacji Miasta i Terenów Wiejskich Gminy Międzyrzecz na lata 2008–2013, Międzyrzecz 2008, s. 27.: Miasto Odległość Gorzów Wlkp. 48 km Zielona Góra 67 km Poznań 117 km Szczecin 156 km Wrocław 216 km Warszawa 418 km Berlin 180 km