Działalność w Krakowie i Wilnie W 1908 objął powstałą na Wydziale Teologicznym Uniwersytetu Jagiellońskiego Katedrę Chrześcijańskich Nauk Społecznych. We wrześniu 1910 został profesorem zwyczajnym nauk chrześcijańsko-społecznych w UJ. Jego obecność na uczelni i wykłady z „socjologii chrześcijańskiej” wywołały sprzeciw części słuchaczy, którzy odebrali to jako „klerykalną agitację”. Doszło do strajku, podczas którego Uniwersytet od 31 stycznia do 27 marca 1911 roku był zamknięty. Wydarzenia te znane są pod nazwą „zimmermanniady”, w ich wyniku kilkuset studentów poniosło dotkliwe konsekwencje.
W 1911, ukrywając się pod pseudonimem Tektander, opublikował pracę pt. Moja Pani. Studium z natury. Przyczynek do psychologii księżych gospodyń. Dziełko to wyśmiane zostało publicznie m.in. przez posła Józefa Putka podczas sejmowej debaty nad budżetem oświaty w 19241924 lipiec 1, Warszawa. Przemówienie posła Józefa Putka podczas debaty sejmowej nad budżetem Ministerstwa Wyznań Religijnych i Oświecenia Publicznego, [w:] Materiały źródłowe do dziejów polskiego ruchu ludowego, t. 2: 1918-1931, zebrali i oprac. S. Giza i S. Lato, Warszawa 1967, s. 105..