W tym samym czasie wprowadzono model "DiTech" z elektronicznym bezpośrednim wtryskiem paliwa, umożliwiającym redukcję zużycia paliwa do 2 l/100 km, redukcję zużycia oleju o 60%, a także wzrost mocy i uzyskanie normy emisji spalin EURO 2 . Jednocześnie model ten znany jest z problemów z układem wtryskowym oraz utrudnioną naprawą. Większość tych problemów jest spowodowana nieprawidłową eksploatacją oraz brakiem wiedzy na temat diagnostyki i brakiem specjalistycznych narzędzi.
Od 2003 r. w wyniku włączenia firmy Aprilia do koncernu Piaggio rozpoczęto montaż nowych silników produkcji Piaggio. Od lipca 2003 roku zastąpiono jednostkę napędową DiTech jednostką napędową Purejet, stosowanym również w Piaggio NRG Purejet oraz Gilera Runner Purejet. Model z silnikiem DiTech nadal jest produkowany na eksport do USA.
Model ten jest wciąż produkowany z pewnymi zmianami pod nazwą SR 50 StreetAprilia SR 50 Street na stronie producenta.
Trzecia generacja - SR 50 R (od 2005 r.)
thumb|Aprilia SR50 Malossi biorąca udział w wyścigach skuterów Ostatnia generacja modelu charakteryzuje się niezwykłym sportowym designem, pochodzącym wprost z motocykli sportowych Aprilia.