Pontus Farnerud (ur. 4 czerwca 1980 roku w Helsingborgu) – szwedzki piłkarz występujący na pozycji pomocnika. Od 2014 gra w Glumslövs FF. Jego brat, Alexander, również jest zawodowym piłkarzem.
Kariera klubowa Pontus Farnerud swoją piłkarską karierę rozpoczynał w drużynie Landskrona BoIS, dla której od 1996 do 1998 roku rozegrał 55 meczów i zdobył czternaście goli. Następnie wyjechał ze Szwecji do Francji, gdzie podpisał kontrakt z AS Monaco. W nowym klubie grał do 2003 roku i w tym czasie zdołał rozegrać 70 spotkań. Razem z zespołem czerwono-białych w 2000 roku sięgnął po mistrzostwo Francji. Później po zakończeniu kontraktu, przeniósł się do RC Strasbourg, dla którego zaliczył 30 występów. W 2004 roku Farnerud powrócił do AS Monaco, by wystąpić tam w 24 meczach. W kolejnych rozgrywkach ponownie zasilił Strasbourg i rozegrał dla tej drużyny 32 spotkania. W 2006 roku Farnerud został piłkarzem Sportingu CP. Przez dwa sezony wystąpił tylko w 23 meczach w lidze, wywalczył Puchar Portugalii oraz dwa razy Superpuchar Portugalii. W 2008 roku szwedzki gracz odszedł do Stabæk Fotball i razem z nim wywalczył pierwsze w historii klubu mistrzostwo Norwegii. W 2012 roku przeszedł do IFK Göteborg.