Thomas Paulus (ur. 14 marca 1982 w Kelheim) – niemiecki piłkarz występujący na pozycji obrońcy. W 2007 roku wraz z 1. FC Nürnberg zdobył Puchar Niemiec.
Kariera Thomas Paulus treningi rozpoczynał jako piłkarz małych klubów: SV Töging, a następnie TV Parsberg. W 1997 roku trafił do szkółki 1. FC Nürnberg. Do kadry seniorskiego zespołu przebił się dopiero przed sezonem 2003/2004, w którym to pomógł drużynie w awansie do ekstraklasy Niemiec W 1. Bundeslidze zadebiutował 23 października 2004 meczem z Werderem Brema. W 2007 roku zdobył z klubem Puchar Niemiec, jednak nie zagrał w tych rozgrywkach żadnego spotkania.
W następnym sezonie grał już w Erzgebirge Aue, które zapłaciło za jego transfer 150 tysięcy euro. Na zakończenie rozgrywek piłkarze z Aue zajęli szesnastą lokatę i spadli do 3. Ligi. W 2010 roku, przy wydatnej pomocy Paulusa, wrócili do 2. Bundesligi. W sezonie 2010/2011 drużyna Thomasa Paulusa zajęła piątą lokatę, a on został trzecim najskuteczniejszym piłkarzem zespołu.