przedłużono masywne zadaszenie harmonizujące z bryłą budynku, tworząc osłoniętą od opadów powierzchnię dla pasażerów.
Podczas ówczesnej budowy, przy budynku dworca wybudowano pod torami nowe przejście podziemne, a zlikwidowano przejście pierwotne (prowadzące tylko na południe) na wschodnim krańcu dwukrawędziowego peronu.
W XXI wieku, w ramach modernizacji linii kolejowej E30 na odcinku Podłęże – Rzeszów Zachodni (2015) przeprowadzono kolejną przebudowę stacji. Dotychczasowe dwa perony (peron 1. – jednokrawędziowy, peron 2. – dwukrawędziowy) zostały wyburzone. Na ich miejscu wybudowano dwa nowe perony jednokrawędziowe (jedna krawędź w kierunku Krakowa, druga w kierunku Tarnowa/Rzeszowa Głównego/Krynicy-Zdroju). Przejście podziemne zostało przebudowane, zamontowano dwie windy i jedną platformę ruchomą dla osób z wózkami. Tory kolejowe również przebudowano i dostosowano do prędkości 160 km/h. Od 2012 roku budynek dworca kolejowego jest zamknięty dla pasażerów.
W pobliżu dworca artysta plastyk Wilhelm Sasnal pozostawił swoją konstrukcję przestrzenną z kręgów kanalizacyjnych. Dworzec w Tarnowie Mościcach w 2011 był punktem wystawy Tarnów.