Kontrola oraz sterowanie pracą oczyszczalni realizowane jest przez komputer w sterowni oczyszczalni.
Stopień oczyszczania ścieków został osiągnięty w pierwszych miesiącach po przekazaniu do eksploatacji. Analizy prób ścieków potwierdzają uzyskanie jeszcze wyższego stopnia redukcji zanieczyszczeń i spełnienie warunków pozwolenia oraz norm unijnych w pełnym zakresie.
W oczyszczalni zachodzi proces fermentacji mezofilowej podczas stabilizacji osadu. W procesie tym powstaje biogaz o zawartości metanu około 65%. Osad poddawany jest systematycznym badaniom w laboratorium Oczyszczalni Ścieków oraz przez Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.
Wyprodukowany podczas stabilizacji osadu biogaz w komorach fermentacyjnych jest wykorzystywany do otrzymania energii elektrycznej i cieplnej. Łączne zużycie energii elektrycznej wynosi około 250 000 kWh/miesiąc z czego obecnie ponad 60% uzyskuje się dzięki gazogeneratorom napędzanych za pomocą silników zasilanych biogazem. Energia cieplna produkowana jest podczas pracy gazogeneratorów i pozyskiwana z pomp ciepła. Jej ilość wystarcza całkowicie do zaspokojenia potrzeb technologicznych, grzewczych oraz do ogrzania wody w oczyszczalni.