Życie prywatne W latach 2005–2011 związana była z aktorem porno Jamesem Deenem. W lutym 2008 romansowała z gitarzystą Dave’em Navarro. W 2013 związała się z grafikiem i muzykiem Aaronem Thompsonem, który potem brał udział w jej produkcjach pod pseudonimem „Small Hands”, za którego 31 października 2016 wyszła za mąż. Zamieszkali w Los Angeles. Wystąpili razem w krótkometrażowym dramacie Miłość to śmierć (Love Is Dead, 2016). W 2018 powiedziała „The Sun”: – „Przed moim związkiem z Aaronem spotykałam się z innymi mężczyznami, ale czułam się niepewnie co do swojej pracy, więc powiedziałam mu, żeby zabawiał się z innymi dziewczynami, żeby było sprawiedliwie. Ale nie mogłam sobie z tym poradzić, nie chciałam otwartego związku, choć czułam, że ze względu na moją pracę muszę”. W czerwcu 2019 w Glendale w Kalifornii Joanna Angel i Aaron Thompson rozpoczęli produkcję whisky Doom’s swojego autorstwa. W listopadzie 2024 Joanna Angel poinformowała na Instagramie o rozstaniu z mężem Aaronem Thompsonem, z którym tworzyła małżeństwo przez 13 lat temu, zanim on zaczął zajmować się branżą filmów dla dorosłych.