Dostęp do peronów jest możliwy z dwóch przejść podziemnych, jednocześnie łączących rozdzielone torami centrum Zielonki: "Zosinek", przy wschodniej głowicy peronów, biegnące równolegle do rzeki Długiej, łączące Park Dębinki z ulicą J. Słowackiego, otwarte 20 lutego 2017 r. (wraz z pasem rowerowym) "Zielonka Letnisko", przy zachodniej głowicy peronów, łączące ulice ks. Z. Abramskiego i W. Łukasińskiego, otwarte 11 grudnia 2017 r.
Budynek stacyjny thumb|Peron i budynek stacyjny przed modernizacją (2008) Budynek stacyjny przed modernizacją znajdował się pośrodku jedynego wówczas peronu wyspowego. W jednej jego części znajdowała się poczekalnia, a w drugiej stanowisko kasowe i zaplecze. Przedłużony dach budynku stanowił częściowe zadaszenie peronu. Do zadaszenia budynku przymocowane były megafony oraz oświetlenie. Stylem nawiązywał do budynków stacyjnych spotykanych na reszcie stacji Warszawskiego Węzła Kolejowego. Podobny budynek, mimo modernizacji stacji, ocalał na przystanku Ząbki.