Andrzej Gaberle ukończył studia na Uniwersytecie Jagiellońskim, w 1964 na Wydziale Prawa (prawo) i w 1970 na Wydziale Historyczno-Filozoficznym (socjologia). Był studentem profesora Władysława Woltera. W 1969 uzyskał stopień doktora nauk prawnych, w 1975 stopień doktora habilitowanego. W 1989 otrzymał tytuł naukowy profesora. Przez wiele lat był zawodowo związany z UJ, w latach 1978–2006 kierował Katedrą Kryminologii na tej uczelni. Opublikował liczne prace naukowe z zakresu postępowania karnego, kryminologii i postępowania w sprawach nieletnich. Wykładał także w Krakowskiej Akademii im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego.
Był stypendystą Fundacji Alexandra von Humboldta. Zasiadał w Komitecie Nauk Prawnych Polskiej Akademii Nauk. Należał do Towarzystwa Naukowego Prawa Karnego oraz Polskiego Towarzystwa Kryminologicznego im. prof. Stanisława Batawii.
W wyborach parlamentarnych w 1991 bez powodzenia ubiegał się o mandat poselski z listy Unii Demokratycznej. Od 1993 do 1997 sprawował mandat posła na Sejm II kadencji z listy UD, który uzyskał w okręgu krakowskim. Należał następnie do klubu parlamentarnego Unii Wolności.