Ptaki Na bagnistych terenach Lasów Napiwodzko-Ramuckich stwierdzono gniazdowanie 160 gatunków ptaków. Wiele rzadkich gatunków, są to m.in.: bielik, rybołów, orlik krzykliwy, kania czarna, kania ruda, bocian czarny, dudek, kraska, cietrzew, derkacz, lelek, kropiatka, jastrząb, żuraw.
Płazy i gady Płazy i gady reprezentują prawie wszystkie krajowe nizinne gatunki, są to m.in. wśród płazów: ropucha szara, żaba trawna, żaba moczarowa, żaba wodna, żaba jeziorkowa, kumak nizinny, traszka zwyczajna; wśród gadów: jaszczurka zwinka, jaszczurka żyworódka, padalec zwyczajny, zaskroniec zwyczajny, żmija zygzakowata, żółw błotny.
Ryby W jeziorach i rzekach można zaobserwować ponad 30 gatunków ryb.
Owady Najliczniejszą grupę zwierząt stanowią owady (np. kozioróg dębosz).
Ochrona przyrody Na obszarze puszczy (planowany Park Krajobrazowy Puszczy Napiwodzko-Ramuckiej) znajduje się 11 rezerwatów przyrody: Bagno Nadrowskie (52,0 ha), Dęby Napiwodzkie (37,1 ha), Galwica (95,1 ha), Jezioro Kośno (1248,8 ha), Jezioro Orłowo Małe (4,0 ha), Koniuszanka I (20,0 ha), Koniuszanka II (64,5 ha), Las Warmiński im. prof. Benona Polakowskiego (1815,9 ha), Małga (147,1 ha), Sołtysek (10,0 ha), Źródła rzeki Łyny im. prof.