Do beneficjentów fundacji należą m.in.: Fuller Theological Seminary, Foundational Questions Institute (w skrócie FQXi, przy współudziale fizyków z MIT oraz University of California), The World Science Festival, Stanford University, University of Chicago, Perimeter Institute for Theoretical Physics, Rotary International.

Zabezpieczenie finansowe fundacji wynosi 3,2 miliarda dolarów według stanu na 30 czerwca 2015. Roczny budżet w 2015 roku wyniósł 188 milionów dolarów, wartość udzielonych dotacji w 2016 wyniosła 77,5 miliona dolarów, a wartość aktywnych dotacji według stanu na luty 2017 wyniosła 456 milionów dolarów. Czas trwania dotacji to często do 3 lat, rzadko projekty są utrzymywane przez okres do 5 lat, co stanowi maksymalny okres finansowania projektu.

Działalność fundacji budzi kontrowersje. Krytycy uważają, że wywiera ona nadmierną presję finansową na naukowców, aby wypowiadali się w sposób zbliżający naukę i religię, co ich zdaniem prowadzi do korupcji i szkodzi naucePeter Woit: „They explicitly refuse to support serious science, and instead fund an incredible array of attempts to inject religion into scientific practice. ...