„Prezes NIK był równorzędny ministrom, aczkolwiek nie wchodził w skład rządu, natomiast mógł zabierać głos na posiedzeniach Sejmu i Senatu, uczestnicząc osobiście lub delegując swych zastępców. Na żądanie Sejmu lub Senatu obowiązany był udzielać informacji lub wyjaśnień. Do uprawnień Prezesa NIK należało coroczne przesyłanie Ministrowi Skarbu preliminarza budżetowego Izby celem włączenia do budżetu państwa”.
NIK dzieliła się na: Kolegium NIK, 4 departamenty, Wydział Personalny.
Kolegium NIK zajmowało się: sprawami związanymi z odwołaniem od orzeczeń Departamentów i Izb Okręgowych, zamknięciem rachunków za rok ubiegły, sprawozdaniami związanymi z uwagami do budżetu, ustalaniem zasad kontroli oraz rachunkowych i kasowych przepisów, sprawy do rozstrzygnięcia powierzone przez Prezesa NIK.
Liczbę departamentów ustalał Prezes NIK. W departamentach powoływano kolegia. Orzeczenia kolegiów departamentów były natychmiastowo wykonywane. Od decyzji kolegiów można było się odwołać do Kolegium NIK. Każdy kontrolowany podmiot miał na to 14 dni.
Zadaniem Kolegialnych departamentów było wypowiedzenie się o rewizji faktycznej i następczej oraz odnośnie do zamknięcia poszczególnych rachunków.