Josef Felix Pompeckj (ur. 10 maja 1867 w Groß-Köllen, zm. 8 lipca 1930 w Berlinie) – niemiecki geolog i paleontolog.
Życiorys Syn Ignaza Pompeckjego i Magdalene z domu Norden. Studiował geologię i paleontologię, doktoryzował się w 1889 roku w Królewcu u Wilhelma von Branki. Pracował w Tybindze i Monachium, gdzie w 1894 roku został kustoszem i habilitował się pod kierunkiem Karla Alfreda von Zittla, a w 1893 roku został profesorem nadzwyczajnym. Potem profesor nadzwyczajny w Landwirtschaftlichen Hochschule w Hohenheim (1904–1907), Królewcu (1907–1908), Getyndze (1908–1913) i ponownie w Tybindze (1913–1917). Następnie został profesorem geologii i paleontologii w Berlinie, gdzie w 1917 roku powierzono mu stanowisko dyrektora Instytutu i Muzeum Geologiczno-Paleontologicznego (Geologisch-Paläontologischen Institut und Museum), które to stanowisko piastował do śmierci w 1930 roku. Od 1920 roku członek Niemieckiej Akademii Nauk, w roku akademickim 1925–1926 rektor Uniwersytetu.
W zoologii, w nazwach gatunków opisanych przez niego używa się pełnego nazwiska .
Taksony opisane przez Pompeckjego Pseudocadoceras nanseni (Pompeckj, 1899) Pseudocadoceras petelini (Pompeckj) Mojsvarites Pompeckj, 1895 Xenusion Pompeckj, 1927 Stromatocystis pentagularis Pompeckj, 1896