W 1976 roku wyjechał na zaproszenie Polonii Amerykańskiej uczestnicząc w obchodach 200. rocznicy Niepodległości Stanów Zjednoczonych. Tam też, jako Członek Honorowy Stowarzyszenia Pamięci Kapitana Stanisława Młotkowskiego w WilmingtonStanisław Młotkowski brał udział w walkach podczas wojny domowej w Stanach Zjednoczonych w randze kapitana. Był to krewny (wuj) Jana Młotkowskiego. Zobacz też: , Stanisław Młotkowski, spotkał się z amerykańskimi naukowcami.
Reaktywował zlikwidowane wcześniej Towarzystwo Gimnastyczne "Sokół", zarejestrowane w dniu 6 listopada 1989 roku i nawiązując tym samym do Polskiego Towarzystwa Gimnastycznego "Sokół", które odegrało rolę w odzyskiwaniu niepodległości w latach I wojny światowej jako najliczniejsza organizacja niepodległościowaBenon Misiewicz, Wojsko Polskie XX wieku.
Ponadto Jan Młotkowski napisał kilka pozycji książkowych mówiących o mordach nacjonalistów ukraińskich na Polakach w latach 1939–1947 OUN-B (banderowcy).