Juan Carlos Aguilera Martín (ur. 22 maja 1969 w Madrycie) – piłkarz hiszpański, grający na pozycji prawego obrońcy.
Kariera klubowa Aguilera urodził się w Madrycie, a karierę piłkarską rozpoczął w tamtejszej szkółce piłkarskiej Atlético Madryt. Następnie występował w drużynie B, a w 1987 roku został włączony do kadry pierwszej drużyny. 26 marca 1988 roku zadebiutował w Primera División w przegranym 0:2 wyjazdowym spotkaniu ze Sportingiem Gijón. W swoim pierwszym sezonie zajął z Atlético 3. miejsce w lidze. W sezonie 1988/1989 coraz częściej wybiegał w pierwszym składzie, głównie jako skrzydłowy. Dopiero z czasem został przesunięty na prawą obronę. W 1991 roku zdobył swoje pierwsze trofeum – Puchar Króla. Natomiast w La Liga madrycki klub wywalczył wicemistrzostwo Hiszpanii. W 1992 roku znów został zdobywcą krajowego pucharu, a w lidze Atlético tym razem było trzecie. W zespole „Los Colchoneros” Aguilera występował także w sezonie 1992/1993, ale nie osiągnął w nim sukcesów.