W latach 1992–1993 wyremontowano odcinek Gardeja – Malbork.

Do przełomu XIX i XX wieku wybiegający ze stacji Kwidzyn tor linii kolejowej do Torunia biegł wzdłuż ulicy Plantowej (od 1901 razem z torem linii wąskotorowej z Marezy). Przełożenie linii nastąpiło w związku z budową linii kolejowej do Smętowa. W latach dwudziestych XX wieku przebudowano odcinek Grudziądz Owczarki – Rogóźno Pomorskie celem poprawy parametrów eksploatacyjnychLinia kolejowa () • - / © Atlas Kolejowy Polski i Czech.

XXI wiek Ze względu na pogarszający się stan techniczny linii na odcinku Grudziądz Owczarki – Gardeja 1 lutego 2008 zawieszono kursowanie pociągów na odcinku Grudziądz – Kwidzyn. Po wprowadzeniu ograniczenia prędkości do 10 km/h Urząd Marszałkowski Województwa Kujawsko-Pomorskiego wycofał się ze wsparcia finansowego, co spowodowało podtrzymanie decyzji dyrekcji spółki Przewozy Regionalne o wstrzymaniu kursów na tym odcinku. kpinfo.pl, 25 stycznia 2008..

1 marca 2009 nastąpiło wznowienie kursowanie pociągów na odcinku Grudziądz – Kwidzyn, z jednoczesnym powierzeniem przez organizatora przewozów obsługi pasażerskiej na całej długości linii spółce Arriva RP.