W 2004 roku w filmie Godzilla: Ostatnia wojna Zilla wystąpił jako jeden z potworów atakujących cały świat. Celem Zilli było Sydney. Wraz z innymi potworami został teleportowany nagle przez kosmitów zwanych Xilieniami, chcących ocalić Ziemian. Jednak okazało się, że to Xilieni stali za atakami potworów jako część planów podbicia Ziemi. Doktor Miyuki Otonashi wykazała, że Zilla i inne potwory mają w sobie , dzięki czemu Xilieni mogą je kontrolować. W odpowiedzi Siły Obrony Ziemi (oryg. Earth Defense Force) wypuściły z Obszaru G (oryg. Area G) Godzillę, gdyż ten jest pozbawiony zasady M i może stanowić największą obronę Ziemi. Dowódca Xilienów rozkazał teleportowanie Zilli do Sydney, by stoczył bój z Godzillą. Zilla biegł wprost na przeciwnika tylko po to, by zostać mocno odbity ogonem w stronę Opery Sydney. Godzilla nie tracąc czasu zabił go swym termonuklearnym promieniem. Dowódca Xilienów stwierdził, że wiedział o bezużyteczności Zilli. Zilla w tym filmie to pierwszy w historii japońskiego Godzilli potwór całkowicie wygenerowany komputerowo.