Maude Flanders tragicznie zginęła w sezonie 11, a dokładniej w odcinku [11x14] „Znowu sam, taramtamtam”, gdy uderzyły w nią koszulki wystrzelone z wyrzutni „Demonicznych fanek” na stadionie wyścigów samochodowych, spadła z dużej wysokości i umarła na miejscu. Była to najgłośniejsza śmierć w serialu „Simpsonowie”. Od tamtego czasu Ned popadł w depresję, jednakże wkrótce później zdecydował się zapomnieć o Maude (w czym pomaga mu rodzina Simpsonów) i pozbywał się wszystkiego, co mu o niej przypominało, choć najbardziej było mu żal odcisku Maude na swoim łóżku. W sezonie 12 Ned zrealizował marzenie Maude, którego nie zdążyła zrealizować sama – wybudował modlitewny park rozrywki w Springfield.

Po swojej śmierci Maude pojawia się w serialu sporadycznie, zazwyczaj w serii „Straszny domek na drzewie” jako duch lub zjawa, oraz w zwykłych odcinkach ukazujących przeszłość lub we wspomnieniach innych bohaterów. Czasem ukazuje się w odcinkach przedstawiających aktualne wydarzenia jako postać z zaświatów.

W odcinku „Ślub Lisy” z 6 serii (gdy Maude jeszcze żyła), ukazującym przyszłość Simpsonów, Maude, jako znacznie starsza osoba, wraz z Nedem pokazana jest na weselu Lisy.