Francisco Javier Pérez Villarroya (ur. 6 sierpnia 1966 w Saragossie) – piłkarz hiszpański grający na pozycji defensywnego pomocnika.
Kariera klubowa Villarroya urodził się w Saragossie i tam też rozpoczął karierę piłkarską w klubie Real Saragossa. Po występach w drużynach młodzieżowej i rezerwowej został w 1984 roku członkiem pierwszego zespołu. 9 września tamtego roku zadebiutował w Primera División w przegranym 0:4 wyjazdowym spotkaniu z FC Barcelona. Poza debiutem nie wystąpił w żadnym spotkaniu, a do składu Realu wrócił dopiero w sezonie 1986/1987, ale wtedy tylko dwukrotnie pojawiał się na boiskach ligowych. Rok później był już graczem pierwszego składu Realu i przez kolejne trzy lata miał pewne miejsce w wyjściowej jedenastce. Łącznie w klubie z Saragossy wystąpił 100 razy i zdobył 6 bramek.
W 1990 roku Villarroya przeszedł do Realu Madryt. W barwach „Królewskich” swój pierwszy mecz rozegrał 8 września przeciwko Sevilli (0:2). W Realu grał w pierwszym składzie i w 1991 roku zajął 3. miejsce w La Liga, a w 1992 został z nim wicemistrzem Hiszpanii. Wystąpił też w finale Pucharu Hiszpanii, który Real przegrał 0:2 z Atlético Madryt. W 1993 roku znów został wicemistrzem kraju, tym razem jako rezerwowy i po raz pierwszy w karierze zdobył hiszpański puchar.