31 marca 1993 roku o godzinie 19:20, podczas prac remontowych w stoczni w Elsfleth, na statku wybuchł pożar. Ogień, spowodowany pracami spawalniczymi, zniszczył całe wnętrze jednostki – od części dziobowej po grodź maszynową. Ekspertyzy wykazały, że po pożarze zachowanych zostało 60% wartości technicznej statku. Podjęto decyzję o jego odbudowie. 3 maja 1993 roku powiat Wesermarsch przekazał „Großherzogin Elisabeth”, wraz z należnym odszkodowaniem z tytułu ubezpieczenia kadłuba, na własność stowarzyszenia szkolnego. Zlecenie na remont otrzymała stocznia w Elsfleth. 30 września 1993 roku zakończono prace polegające na całkowitym demontażu wnętrza. Odbudowa jednostki była wspólnym wysiłkiem mieszkańców regionu, członków stowarzyszenia, lokalnych władz oraz sympatyków „Lissi”. Łączny koszt napraw wyniósł 4,3 mln marek niemieckich.
Od 1993 roku „” jest wykorzystywana głównie jako statek szkolny Fachbereichs Seefahrt und Logistik der Jade Hochschule. Oferuje też rejsy komercyjne. Nadane w Niemczech imię ma upamiętniać inną jednostkę o tej nazwie,