Nie był to jednak udany powrót, gdyż Alliot spowodował sporo kolizji i wypadków, za co został ostro skrytykowany przez zespoły i komentatorów sportowych. James Hunt nazwał go „jednym z najgorszych kierowców, którzy jeździli bolidem F1”. Po tym Alliot zrobił przerwę od startów królowej sportów motorowych i przeszedł do zespołu Peugeot, kierowanego wtedy przez Jeana Todta. Zaowocowało to 3. miejscem w 1992 i 24h Le Mans.
W sezonie 1993 Alliot wrócił do F1 z Larrousse, osiągając w Grand Prix San Marino najlepsze (piąte) miejsce w swoich startach w F1. Po roku objął funkcję kierowcy testowego w zespole McLaren. Podczas Grand Prix Węgier zastąpił Mikę Häkkinena. W kwalifikacjach zajął 14. miejsce, wyścigu nie ukończył. Następnie Alliot zmienił Oliviera Berettę z Larrousse na czas Grand Prix Belgii. Startował z 19 pola, wyścigu jednak nie ukończył przez problemy z jednostką napędową. Jednocześnie był to jego ostatni wyścig w Formule 1.
Wyniki 24h Le Mans Rok Zespół Partnerzy Samochód Klasa Okr.