Jürgen Patocka (ur. 30 lipca 1977 w Wiedniu) – piłkarz austriacki grający na pozycji środkowego obrońcy.

Kariera klubowa Karierę piłkarską Patocka rozpoczął w klubie SC Untersiebenbrunn. W jego barwach występował w rozgrywkach Regionalligi, a w 1999 roku awansował z nim do drugiej ligi, dzięki wygraniu barażu z zespołem SC Spittal/Drau. Jürgen został jednak na trzecim froncie i przeszedł do zespołu Florisdorfer AC, w którym grał do końca 2000 roku w Regionallidze.

Na początku 2001 Patocka zmienił barwy klubowe i został piłkarzem drugoligowej Austrii Lustenau. Tam był jej czołowym obrońcą, a w 2002 roku był bliski awansu do pierwszej ligi, jednak Austria zakończyła sezon o 2 punkty za pierwszym SV Pasching. W 2003 roku zajął z Austrią 3. miejsce, a w 2004 – ponownie 2.

Latem 2004 Patocka w końcu trafił do ekstraklasy Austrii, gdy przeszedł na zasadzie wolnego transferu do SV Mattersburg. W lidze zadebiutował 14 lipca w przegranym 1:3 wyjazdowym spotkaniu ze Sturmem Graz. W Mattersburgu był podstawowym zawodnikiem, a na koniec sezonu 2006/2007 zajął z nim 3. miejsce, najwyższe w historii klubu.