Burton nazywał siebie ateistąWright (1906) „Jakieś trzy miesiące przed śmiercią Sir Richarda”, pisze do mnie pan PP Cautley, wicekonsul w Trieście, „siedziałem przy herbacianym stole Sir Richarda z naszym duchownym i rozmowa zwracała się w stronę religii, Sir Richard oświadczył: „Jestem ateistą".. Jego doświadczenia religijne były zróżnicowane, w tym uczęszczanie na nabożeństwa katolickie, zostanie braminem Nāgar, przyjęcie sikhizmu, przejście na islam i poddanie się chillá dla sufizmu Qadiri. Odnosząc się do muzułmańskich przekonań Burtona, Ed Rice stwierdza: „W ten sposób został obrzezany i został muzułmaninem, żył jak muzułmanin, modlił się i praktykował jak muzułmanin”. Co więcej, Burton „miał prawo nazywać siebie hāfizem, kimś, kto potrafi recytować Koran z pamięci”Rice, Ed (1990). Captain Sir Richard Francis Burton: the secret agent who made the pilgrimage to Mecca, discovered the Kama Sutra, and brought the Arabian nights to the West. New York: Charles Scribner's Sons. p. 22. ISBN 978-0684191379.
Po śmierci męża Isabel zniszczyła wiele dokumentów, które do niego należały.