Natomiast w sezonach 2010/2011 i 2011/2012, Wellington Phoenix kończyło udział w serii finałowej odpowiednio na rundzie eliminacyjnej (przegrana 0:1 z Adelaide United) i ćwierćfinale (przegrana 2:3 po dogrywce z Perth Glory FC).
Przed sezonem 2011/2012 ówczesny właściciel klubu, Terry Serepisos miał problemy finansowe, które przyczyniły się m.in. do likwidacji jego spółki Century City Football Ltd. przez Inland Revenue Department. We wrześniu 2011 roku Wellington Phoenix został przejęty przez nowego właściciela Roba Morrisona.
Po rezygnacji trenera Rickiego Herberta w lutym 2013 roku, do końca sezonu 2012/2013 klub prowadził Chris Greenacre (były piłkarz Wellington Phoenix w latach 2009–2012). Natomiast od sezonu 2013/2014, klub prowadził Ernie Merrick. Za czasów jego kadencji klub jeden raz w sezonie 2014/2015 awansował do serii finałowej rozgrywek, którą zakończył na rundzie eliminacyjnej (porażka 0:2 z Melbourne City FC). Ernie Merrick prowadził klub do grudnia 2016 roku, natomiast do końca sezonu 2016/2017 klub poprowadził duet trenerski: Des Buckingham i Chris Greenacre. W lutym 2016 roku klub Wellington Phoenix otrzymał od FFA licencje na występowanie w A-League przez kolejne 10 lat.