W dniu 30 września 1989 do struktur ASW włączona została kształcąca kadrę Służby Bezpieczeństwa MSW Wyższa Szkoła Oficerska im. Feliksa Dzierżyńskiego w Legionowie (zamiejscowy „Wydział Bezpieczeństwa Państwa”) oraz Wyższa Szkoła Oficerska im. Franciszka Witolda-Jóźwiaka w Szczytnie (zamiejscowy „Wydział Porządku Publicznego”). W Warszawie funkcjonował nadal Wydział Polityczno-Prawny.
W 1990 pracownicy ASW zostali poddani weryfikacji, co budziło kontrowersje, ponieważ zgodnie z postanowieniem Zarządzenia nr 51/90 Ministra Spraw Wewnętrznych z 25 czerwca 1990 w sprawie oceny byłych funkcjonariuszy Służby Bezpieczeństwa nigdy takimi funkcjonariuszami nie byli, a Instrukcja Przewodniczącego Centralnej Komisji Kwalifikacyjnej z 25 czerwca 1990 za funkcjonariuszy Służby Bezpieczeństwa uznawała – w przypadku ASW – wyłącznie osoby zatrudnione w zamiejscowym Wydziale Bezpieczeństwa Państwa w Legionowie (pkt. 2 lit. „n” cytowanej instrukcji).
Obecnie na mocy ustawy o IPN ASW jest zaliczana do organów bezpieczeństwa państwa Polski Ludowej.
Komendanci ASW Komendantami (rektorami) Akademii Spraw Wewnętrznych byli kolejno: płk Marian Lipka (19 września 1972 r. – 30 września 1976 r.) płk Zenon Trzciński (1 października 1976 r. – 7 grudnia 1980 r.) płk/gen. bryg. Tadeusz Walichnowski (8 grudnia 1980 r.