W niemal całkowicie zniszczonej Wiosce Ukrytego Liścia pojawia się główny bohater i pokonuje Paina. Nagato wskrzesza zmarłych w walce. Sasuke staje się członkiem Akatsuki i atakuje Killera Bee. Nowym Hokage zostaje Danzō i wydaje rozkaz likwidacji zbiegłego Uchihy.
Drugi sezon również został wyprodukowany przez studio Pierrot. Seria była emitowana po raz pierwszy na kanale TV Tokyo Network od 15 lutego 2007 roku do 23 marca 2017 roku i składa się z 500 odcinków po 30 minut.
Filmy pełnometrażowe Filmy zostały stworzone przez: Tensaia Okamurę, Hirotsugu Kawasakiego, Toshiyuki Tsuru, Hajime Kamegakiego, Masahiko Muratę (trzy filmy Naruto Shippūden), Hayato Date.
Za oprawę muzyczną odpowiadają Toshio Masuda oraz Yasuharu Takanashi (od czwartej odsłony).
Lp. Tytuł Data premiery (Japonia)
Original video animation N/o Tytuł odcinka Premiera
Radio Audycje radiowe Naruto są emitowane w Japonii od 2003 roku. Od marca 2007 audycja nosiła nazwę , jednak w kwietniu tego samego roku nazwa została zmieniona na i pod tym tytułem emitowana jest do dziś.