Zbiory Zbiory Muzeum Ziemi liczyły w 2023 roku ok. 172 tys. obiektów pochodzących z obszaru Polski i różnych regionów świata. Są wśród nich wartościowe kolekcje minerałów i skał, kamieni ozdobnych oraz meteorytów, zasobne zbiory skamieniałości roślin i zwierząt. Posiada bogate zbiory bursztynu zaliczane do najciekawszych tego typu kolekcji przyrodniczych w świecie. Odrębną kategorię stanowią cenne archiwalia z zakresu historii nauk o Ziemi.

Przy budynku zgromadzono m.in. elementy kamiennych dekoracji zniszczonych pałaców Brühla i Kronenberga.

Zbiory Biblioteki Muzeum Ziemi, liczą ponad 54 tys. pozycji i są jednym z większych w Polsce zasobów piśmiennictwa z zakresu nauk o Ziemi.

Publikacje

Muzeum wydawało cyklicznie dwa wydawnictwa: „Prace Muzeum Ziemi” i „Opracowania dokumentacyjne Muzeum Ziemi”.

Placówka kontynuowała również rozpoczętą w 1938 roku serię „Wiadomości Muzeum Ziemi”. Ostatnim zarejestrowanym tomem tego czasopisma w internetowych katalogach bibliotecznych jest tom 6 z 1952 roku.