– 25. z kolei, a trzeci w serii Shinsei, film o Godzilli. Film różni się od pozostałych obrazów z tej serii tym, że w przeciwieństwie do pozostałych filmów Godzilla nie jest tylko potworem atakującym Japonię, ale też metaforą zniszczeń wojennych.
Fabuła W 1954 r. gigantyczny jaszczur zwany Godzillą zaatakował Japonię i został zniszczony nieznaną substancją chemiczną. W 1998 r. inne monstrum zaatakowało Amerykę, jednak Japończycy są pewni, że to nie Godzilla. Mimo to admirał Taizo Tachibana uważa, że należy być w pogotowiu.
W 2002 r. amerykański atomowy okręt podwodny zaginął w pobliżu Guam. Okręt Satsuma zostaje wysłany, aby zbadać sprawę. Na miejscu jedna z łodzi zostaje zniszczona przez silny prąd, a pilot drugiej z przerażeniem obserwuje poruszające się, świecące w mroku kolce grzbietowe. Godzilla powraca.